L’Etablissement National de la Navigation Aérienne est structuré comme suit :
- DDNA : Direction du Développement de la Navigation Aérienne.
- DENA : Direction de l’Exploitation de la Navigation Aérienne.
- DTNA : Direction Technique de la Navigation Aérienne.
- DRFC : Direction des Ressources des Finances et de la Comptabilité.
- DJRH : Direction Juridique et des Ressources Humaines.
- CQRENA : Centre de Qualification, de Recyclage et d’Expérimentation de la Navigation Aérienne.
- DL : Direction de la Logistique.
- FIU : Flight Inspection Unit
- AERODROMES : Directions de la Sécurité Aéronautique.